Née en 1931 dans un petit village du Léon (Finistère), Mona Ozouf gardera toujours sa double identité issue de ses racines bretonnes et de son éducation laïque. Ses parents, tous deux instituteurs, sont des militants de la cause bretonnante. Lorsqu’elle perd son père, à l’âge de quatre ans, elle est élevée par une grand-mère et une mère à la fois tendres et austères, très attachées à la décence et à la dignité. Elle se réfugie alors dans les livres, qui lui ouvrent les horizons auxquels elle n’a pas accès dans l’univers clos du cocon familial .
Après des études studieuses, au lycée de Saint-Brieuc puis en classe préparatoire à Paris - où sa mère et sa grand-mère la suivent - elle est admise à l’École nationale supérieure de jeunes filles et en sort agrégée de philosophie en 1955. C’est durant cette période qu’elle rencontre des historiens qui vont orienter son parcours : son mari Jacques Ozouf (1928-2006), avec qui elle aura deux enfants, et François Furet, qui lui insuffle sa passion pour la Révolution française.